วัดคฤหบดี ตั้งอยู่ฝั่งธนบุรี สร้างในสมัย ร.๓ พระประธานในพระอุโบสถ คือ พระพุทธแซกคำ ซึ่งมีอายุกว่า ๙๐๐ ปี เมื่อเร็วๆ นี้ วัดคฤหบดี ได้ประกอบพิธีบรรจุพระบรมสารีริกธาตุ ในพระบรมธาตุเจดีย์ ซึ่งสร้างขึ้นตรงบริเวณริมแม่น้ำเจ้าพระยา     ภายในพระบรมธาตุเจดีย์ มีห้องที่ประดิษฐานพระบรมสารีริกธาตุ ซึ่งเมื่อปี ๒๔๔๑ (ค.ศ.๑๘๙๘) ชาวอังกฤษได้ค้นพบโดยบังเอิญในผอบ ที่บริเวณอันเคยเป็นที่ตั้งของเมืองกบิลพัสดุ์ บนผอบดังกล่าวมีจารึกเป็นตัวอักษรพราหมี ระบุว่า เป็นพระบรมสารีริกธาตุในส่วนแบ่งของพระราชวงศ์ศากยะ ถือว่าเป็นพระบรมสารีริกธาตุซึ่งพบแห่งเดียวในโลก ที่มีหลักฐานเป็นลายลักษณ์อักษรอย่างแน่ชัด  

 ต่อมา ได้มีพระสงฆ์ชาวไทยรูปหนึ่ง ซึ่งทรงผนวชอยู่ที่ศรีลังกา พระนาม "พระชินวรวงศ์" (พระองค์เจ้าปฤษฎางค์) เสด็จธุดงค์ไปในที่เกิดเหตุในขณะนั้น จึงได้ทรงติดต่ออุปราชอินเดีย ขอให้ถวายพระบรมสารีริกธาตุแด่ พระบาทสมเด็จพระพุทธเจ้าหลวง ซึ่งรัฐบาลอังกฤษก็ได้ดำเนินการตามนั้น

 พระบรมสารีริกธาตุ ซึ่งเป็นกระดูกที่เผาไม่หมดของสมเด็จพระสัมมาสัมพุทธเจ้า ได้อัญเชิญขึ้นไปประดิษฐานบนพระบรมบรรพต (ภูเขาทอง) ที่กรุงเทพฯ แต่มีบางส่วนที่พระบาทสมเด็จพระพุทธเจ้าหลวงได้พระราชทานให้ประเทศญี่ปุ่น และชาวพุทธในประเทศอื่นๆ รวมถึงศรีลังกา

 ในส่วนของประเทศศรีลังกา พระบรมสารีริกธาตุจากกบิลพัสดุ์ได้รับการอัญเชิญไปประดิษฐานอยู่ที่ วัดศรีสุภูติวิหาร อ.วัสกาดูวา และ วัดทิปทุตตมะรามา (วัดไทย) กับ วัดโพธิรักษ์รามา ซึ่งทั้ง ๒ วัดนี้ พระชินวรวงศ์ทรงเป็นเจ้าอาวาส
นอกจากนี้ยังมี พระบรมสารีริกธาตุ อีกส่วนหนึ่งเป็นองค์เล็กๆ ทายาทตระกูล “สุขุม” ได้เก็บรักษาไว้ ด้วย เจ้าพระยายมราช (ปั้น) คงได้รับพระราชทาน เมื่อครั้งได้โปรดเกล้าฯ ให้เดินทางไปอัญเชิญพระบรมสารีริกธาตุมายังกรุงสยาม ปัจจุบันบรรจุในเจดีย์ที่ วัดสุนันทวนาราม จ.กาญจนบุรี

 เมื่อปี ๒๕๔๗ เจ้าอาวาสวัดโพธิรักษ์รามา ได้แบ่งพระบรมสารีริกธาตุองค์หนึ่งให้ ม.ล.อนงค์ ชุมสาย นิลอุบล คือ องค์ที่อัญเชิญมาจากศรีลังกา และได้บรรจุในพระบรมธาตุเจดีย์ วัดคฤหบดี ในพ.ศ.๒๕๕๔

 และเมื่อปลายปี ๒๕๔๗ เจ้าอาวาสวัดทิปทุตตมะรามา ได้มอบพระบรมสารีริกธาตุอีกองค์หนึ่งให้ธนาคารแห่งประเทศไทย ซึ่งปัจจุบันได้ประดิษฐานในห้องพระ บนพระตำหนักวังบางขุนพรหม ฝั่งตรงข้ามกับวัดคฤหบดี

 รูปแบบสถาปัตยกรรม พระบรมธาตุเจดีย์ วัดคฤหบดี มีที่มาจากเจดีย์ทิศวัดเจ็ดยอด จ.เชียงใหม่ ซึ่งก็ดัดแปลงมาจากพระสถูปพระพุทธกายา แต่พระบรมธาตุเจดีย์มีรูปแบบที่เรียบง่าย ไม่มีเครื่องประดับ ส่วนประตูเข้าองค์พระเจดีย์ได้เลียนแบบมาจากวัดศรีชุม จ.สุโขทัย ความเรียบง่ายนี้สะท้อนด้วยการทาสีขาวทั้งองค์พระเจดีย์ ยกเว้นยอดซึ่งทาสีทอง เป็นรูปจำลองของผอบที่บรรจุพระบรมสารีริกธาตุ พร้อมด้วยคำจารึกโบราณที่กล่าวข้างต้น